Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TAF1DQ9H5J8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TAF1DQ9H5J8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms