Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S5

RNF39, RING finger protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF39Q9H2S5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 AC096631.1-202ENST00000440162 917 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 MAPK10-223ENST00000511167 1265 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 AC020763.2-201ENST00000623155 1255 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 SPATA45-201ENST00000332912 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 AC092723.2-201ENST00000624955 793 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 CLCN5-205ENST00000482218 449 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF39Q9H2S5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms