Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZQ3

COMMD5, COMM domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD5Q9GZQ3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD5Q9GZQ3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD5Q9GZQ3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD5Q9GZQ3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD5Q9GZQ3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD5Q9GZQ3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD5Q9GZQ3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD5Q9GZQ3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD5Q9GZQ3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD5Q9GZQ3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD5Q9GZQ3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD5Q9GZQ3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD5Q9GZQ3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD5Q9GZQ3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD5Q9GZQ3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD5Q9GZQ3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD5Q9GZQ3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD5Q9GZQ3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD5Q9GZQ3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD5Q9GZQ3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD5Q9GZQ3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD5Q9GZQ3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD5Q9GZQ3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD5Q9GZQ3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD5Q9GZQ3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD5Q9GZQ3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD5Q9GZQ3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD5Q9GZQ3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD5Q9GZQ3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COMMD5Q9GZQ3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms