Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT23Q9C075 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT23Q9C075 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT23Q9C075 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT23Q9C075 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT23Q9C075 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT23Q9C075 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT23Q9C075 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms