Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW2

SLC13A1, Solute carrier family 13 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A1Q9BZW2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC13A1Q9BZW2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC13A1Q9BZW2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms