Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
BCO2Q9BYV7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms