Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC106Q9BWC9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms