Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HIGD2AQ9BW72 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms