Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF4Q9BUZ4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF4Q9BUZ4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms