Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
EFHD1Q9BUP0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFHD1Q9BUP0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFHD1Q9BUP0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFHD1Q9BUP0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EFHD1Q9BUP0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFHD1Q9BUP0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EFHD1Q9BUP0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFHD1Q9BUP0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFHD1Q9BUP0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFHD1Q9BUP0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFHD1Q9BUP0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFHD1Q9BUP0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFHD1Q9BUP0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFHD1Q9BUP0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFHD1Q9BUP0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFHD1Q9BUP0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFHD1Q9BUP0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFHD1Q9BUP0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFHD1Q9BUP0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFHD1Q9BUP0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFHD1Q9BUP0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFHD1Q9BUP0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFHD1Q9BUP0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFHD1Q9BUP0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFHD1Q9BUP0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFHD1Q9BUP0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFHD1Q9BUP0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFHD1Q9BUP0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFHD1Q9BUP0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFHD1Q9BUP0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFHD1Q9BUP0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFHD1Q9BUP0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFHD1Q9BUP0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms