Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MCMBPQ9BTE3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms