Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MTA3Q9BTC8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTA3Q9BTC8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms