Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HERPUD2Q9BSE4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HERPUD2Q9BSE4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms