Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM79Q9BSE2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM79Q9BSE2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM79Q9BSE2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM79Q9BSE2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM79Q9BSE2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM79Q9BSE2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM79Q9BSE2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM79Q9BSE2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM79Q9BSE2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM79Q9BSE2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM79Q9BSE2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM79Q9BSE2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM79Q9BSE2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM79Q9BSE2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM79Q9BSE2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM79Q9BSE2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM79Q9BSE2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM79Q9BSE2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM79Q9BSE2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM79Q9BSE2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM79Q9BSE2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM79Q9BSE2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM79Q9BSE2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM79Q9BSE2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM79Q9BSE2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM79Q9BSE2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM79Q9BSE2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM79Q9BSE2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM79Q9BSE2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM79Q9BSE2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM79Q9BSE2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM79Q9BSE2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM79Q9BSE2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM79Q9BSE2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM79Q9BSE2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM79Q9BSE2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM79Q9BSE2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM79Q9BSE2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM79Q9BSE2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM79Q9BSE2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM79Q9BSE2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM79Q9BSE2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM79Q9BSE2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM79Q9BSE2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM79Q9BSE2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM79Q9BSE2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM79Q9BSE2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM79Q9BSE2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM79Q9BSE2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM79Q9BSE2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM79Q9BSE2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM79Q9BSE2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM79Q9BSE2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM79Q9BSE2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM79Q9BSE2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM79Q9BSE2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM79Q9BSE2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM79Q9BSE2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM79Q9BSE2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM79Q9BSE2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM79Q9BSE2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM79Q9BSE2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM79Q9BSE2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM79Q9BSE2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM79Q9BSE2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM79Q9BSE2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM79Q9BSE2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM79Q9BSE2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM79Q9BSE2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM79Q9BSE2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM79Q9BSE2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM79Q9BSE2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM79Q9BSE2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM79Q9BSE2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM79Q9BSE2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM79Q9BSE2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM79Q9BSE2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM79Q9BSE2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM79Q9BSE2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM79Q9BSE2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM79Q9BSE2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM79Q9BSE2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM79Q9BSE2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM79Q9BSE2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM79Q9BSE2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM79Q9BSE2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM79Q9BSE2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM79Q9BSE2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM79Q9BSE2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM79Q9BSE2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM79Q9BSE2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM79Q9BSE2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM79Q9BSE2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM79Q9BSE2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM79Q9BSE2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM79Q9BSE2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM79Q9BSE2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM79Q9BSE2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM79Q9BSE2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms