Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP4

PAAF1, Proteasomal ATPase-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAAF1Q9BRP4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAAF1Q9BRP4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PAAF1Q9BRP4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAAF1Q9BRP4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAAF1Q9BRP4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAAF1Q9BRP4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAAF1Q9BRP4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAAF1Q9BRP4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAAF1Q9BRP4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAAF1Q9BRP4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAAF1Q9BRP4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAAF1Q9BRP4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAAF1Q9BRP4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAAF1Q9BRP4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAAF1Q9BRP4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAAF1Q9BRP4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAAF1Q9BRP4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAAF1Q9BRP4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAAF1Q9BRP4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAAF1Q9BRP4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAAF1Q9BRP4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAAF1Q9BRP4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAAF1Q9BRP4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAAF1Q9BRP4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAAF1Q9BRP4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAAF1Q9BRP4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms