Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SDF4Q9BRK5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms