Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BPIFA3Q9BQP9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BPIFA3Q9BQP9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms