Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RETNLBQ9BQ08 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms