Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED1Q99966 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms