Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID3AQ99856 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID3AQ99856 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID3AQ99856 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms