Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RGPD5Q99666 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD5Q99666 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms