Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LGMNQ99538 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LGMNQ99538 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LGMNQ99538 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LGMNQ99538 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LGMNQ99538 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LGMNQ99538 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LGMNQ99538 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LGMNQ99538 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LGMNQ99538 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LGMNQ99538 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LGMNQ99538 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LGMNQ99538 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LGMNQ99538 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
LGMNQ99538 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LGMNQ99538 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LGMNQ99538 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LGMNQ99538 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LGMNQ99538 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LGMNQ99538 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LGMNQ99538 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LGMNQ99538 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LGMNQ99538 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LGMNQ99538 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LGMNQ99538 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LGMNQ99538 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LGMNQ99538 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LGMNQ99538 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LGMNQ99538 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LGMNQ99538 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LGMNQ99538 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LGMNQ99538 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LGMNQ99538 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LGMNQ99538 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LGMNQ99538 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LGMNQ99538 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LGMNQ99538 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LGMNQ99538 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LGMNQ99538 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LGMNQ99538 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LGMNQ99538 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LGMNQ99538 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LGMNQ99538 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LGMNQ99538 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LGMNQ99538 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LGMNQ99538 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LGMNQ99538 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LGMNQ99538 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LGMNQ99538 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LGMNQ99538 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LGMNQ99538 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LGMNQ99538 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LGMNQ99538 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LGMNQ99538 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LGMNQ99538 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LGMNQ99538 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LGMNQ99538 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LGMNQ99538 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LGMNQ99538 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LGMNQ99538 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
LGMNQ99538 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LGMNQ99538 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LGMNQ99538 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LGMNQ99538 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LGMNQ99538 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LGMNQ99538 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LGMNQ99538 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LGMNQ99538 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LGMNQ99538 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LGMNQ99538 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LGMNQ99538 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LGMNQ99538 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LGMNQ99538 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LGMNQ99538 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LGMNQ99538 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LGMNQ99538 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LGMNQ99538 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LGMNQ99538 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LGMNQ99538 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LGMNQ99538 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LGMNQ99538 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LGMNQ99538 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LGMNQ99538 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LGMNQ99538 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LGMNQ99538 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LGMNQ99538 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LGMNQ99538 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LGMNQ99538 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LGMNQ99538 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LGMNQ99538 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
LGMNQ99538 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LGMNQ99538 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LGMNQ99538 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LGMNQ99538 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LGMNQ99538 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LGMNQ99538 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms