Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RUFY1Q96T51 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUFY1Q96T51 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms