Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
IFT140Q96RY7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
IFT140Q96RY7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
IFT140Q96RY7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
IFT140Q96RY7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
IFT140Q96RY7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
IFT140Q96RY7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
IFT140Q96RY7 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
IFT140Q96RY7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
IFT140Q96RY7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
IFT140Q96RY7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
IFT140Q96RY7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
IFT140Q96RY7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
IFT140Q96RY7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
IFT140Q96RY7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
IFT140Q96RY7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
IFT140Q96RY7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
IFT140Q96RY7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
IFT140Q96RY7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
IFT140Q96RY7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
IFT140Q96RY7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
IFT140Q96RY7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
IFT140Q96RY7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
IFT140Q96RY7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
IFT140Q96RY7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
IFT140Q96RY7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC34.9■■■■□ 3.18
IFT140Q96RY7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
IFT140Q96RY7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
IFT140Q96RY7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
IFT140Q96RY7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
IFT140Q96RY7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
IFT140Q96RY7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
IFT140Q96RY7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
IFT140Q96RY7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
IFT140Q96RY7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
IFT140Q96RY7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
IFT140Q96RY7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
IFT140Q96RY7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
IFT140Q96RY7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
IFT140Q96RY7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
IFT140Q96RY7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
IFT140Q96RY7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.88■■■■□ 3.17
IFT140Q96RY7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
IFT140Q96RY7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
IFT140Q96RY7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
IFT140Q96RY7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
IFT140Q96RY7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
IFT140Q96RY7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
IFT140Q96RY7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
IFT140Q96RY7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
IFT140Q96RY7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
IFT140Q96RY7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
IFT140Q96RY7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
IFT140Q96RY7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
IFT140Q96RY7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
IFT140Q96RY7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
IFT140Q96RY7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
IFT140Q96RY7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
IFT140Q96RY7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
IFT140Q96RY7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
IFT140Q96RY7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
IFT140Q96RY7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
IFT140Q96RY7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
IFT140Q96RY7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
IFT140Q96RY7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
IFT140Q96RY7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
IFT140Q96RY7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
IFT140Q96RY7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
IFT140Q96RY7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
IFT140Q96RY7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
IFT140Q96RY7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
IFT140Q96RY7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
IFT140Q96RY7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC34.84■■■■□ 3.17
IFT140Q96RY7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
IFT140Q96RY7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
IFT140Q96RY7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
IFT140Q96RY7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
IFT140Q96RY7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
IFT140Q96RY7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
IFT140Q96RY7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
IFT140Q96RY7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
IFT140Q96RY7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
IFT140Q96RY7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
IFT140Q96RY7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
IFT140Q96RY7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
IFT140Q96RY7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
IFT140Q96RY7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
IFT140Q96RY7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
IFT140Q96RY7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
IFT140Q96RY7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
IFT140Q96RY7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
IFT140Q96RY7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
IFT140Q96RY7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
IFT140Q96RY7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
IFT140Q96RY7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
IFT140Q96RY7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
IFT140Q96RY7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC34.81■■■■□ 3.16
IFT140Q96RY7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
IFT140Q96RY7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
IFT140Q96RY7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms