Protein–RNA interactions for Protein: Q96QU6

ACCS, 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACCSQ96QU6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ACCSQ96QU6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACCSQ96QU6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACCSQ96QU6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACCSQ96QU6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ACCSQ96QU6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ACCSQ96QU6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACCSQ96QU6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACCSQ96QU6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACCSQ96QU6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACCSQ96QU6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACCSQ96QU6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACCSQ96QU6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACCSQ96QU6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACCSQ96QU6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACCSQ96QU6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACCSQ96QU6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ACCSQ96QU6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACCSQ96QU6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACCSQ96QU6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACCSQ96QU6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACCSQ96QU6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACCSQ96QU6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ACCSQ96QU6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACCSQ96QU6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACCSQ96QU6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACCSQ96QU6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACCSQ96QU6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACCSQ96QU6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACCSQ96QU6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACCSQ96QU6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACCSQ96QU6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms