Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCNAQ96QF7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
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