Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FAM227BQ96M60 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM227BQ96M60 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms