Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SAMD8Q96LT4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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