Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGBD1Q96JS3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGBD1Q96JS3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms