Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TPD52L3Q96J77 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TPD52L3Q96J77 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TPD52L3Q96J77 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TPD52L3Q96J77 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TPD52L3Q96J77 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TPD52L3Q96J77 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TPD52L3Q96J77 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TPD52L3Q96J77 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TPD52L3Q96J77 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TPD52L3Q96J77 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TPD52L3Q96J77 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TPD52L3Q96J77 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TPD52L3Q96J77 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TPD52L3Q96J77 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TPD52L3Q96J77 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TPD52L3Q96J77 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TPD52L3Q96J77 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TPD52L3Q96J77 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TPD52L3Q96J77 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TPD52L3Q96J77 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
TPD52L3Q96J77 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TPD52L3Q96J77 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TPD52L3Q96J77 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms