Protein–RNA interactions for Protein: Q96I25

RBM17, Splicing factor 45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM17Q96I25 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RBM17Q96I25 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBM17Q96I25 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms