Protein–RNA interactions for Protein: Q96EF6

FBXO17, F-box only protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO17Q96EF6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FBXO17Q96EF6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FBXO17Q96EF6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FBXO17Q96EF6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FBXO17Q96EF6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FBXO17Q96EF6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FBXO17Q96EF6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FBXO17Q96EF6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FBXO17Q96EF6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FBXO17Q96EF6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FBXO17Q96EF6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FBXO17Q96EF6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FBXO17Q96EF6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FBXO17Q96EF6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FBXO17Q96EF6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FBXO17Q96EF6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FBXO17Q96EF6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FBXO17Q96EF6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FBXO17Q96EF6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FBXO17Q96EF6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FBXO17Q96EF6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FBXO17Q96EF6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FBXO17Q96EF6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FBXO17Q96EF6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FBXO17Q96EF6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FBXO17Q96EF6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FBXO17Q96EF6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms