Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGBD4Q96DM1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms