Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMIGD2Q96BF3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.6 ms