Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PRG4Q92954 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
PRG4Q92954 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PRG4Q92954 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PRG4Q92954 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PRG4Q92954 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PRG4Q92954 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PRG4Q92954 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PRG4Q92954 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PRG4Q92954 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PRG4Q92954 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PRG4Q92954 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PRG4Q92954 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
PRG4Q92954 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PRG4Q92954 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PRG4Q92954 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PRG4Q92954 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PRG4Q92954 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
PRG4Q92954 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PRG4Q92954 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PRG4Q92954 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PRG4Q92954 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
PRG4Q92954 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms