Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CELF1Q92879 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CELF1Q92879 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CELF1Q92879 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CELF1Q92879 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CELF1Q92879 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CELF1Q92879 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CELF1Q92879 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CELF1Q92879 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CELF1Q92879 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CELF1Q92879 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CELF1Q92879 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CELF1Q92879 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CELF1Q92879 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CELF1Q92879 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CELF1Q92879 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CELF1Q92879 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CELF1Q92879 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CELF1Q92879 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CELF1Q92879 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CELF1Q92879 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CELF1Q92879 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CELF1Q92879 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CELF1Q92879 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CELF1Q92879 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CELF1Q92879 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CELF1Q92879 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CELF1Q92879 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CELF1Q92879 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CELF1Q92879 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CELF1Q92879 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CELF1Q92879 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CELF1Q92879 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CELF1Q92879 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CELF1Q92879 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CELF1Q92879 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CELF1Q92879 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CELF1Q92879 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CELF1Q92879 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CELF1Q92879 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CELF1Q92879 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CELF1Q92879 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CELF1Q92879 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CELF1Q92879 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CELF1Q92879 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CELF1Q92879 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CELF1Q92879 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CELF1Q92879 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms