Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD50Q92878 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD50Q92878 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms