Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATRIPQ8WXE1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms