Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC35.64■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
TRIM41Q8WV44 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC35.62■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.58■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
TRIM41Q8WV44 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
TRIM41Q8WV44 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms