Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV28

BLNK, B-cell linker protein, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLNKQ8WV28 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BLNKQ8WV28 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BLNKQ8WV28 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BLNKQ8WV28 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BLNKQ8WV28 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BLNKQ8WV28 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BLNKQ8WV28 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BLNKQ8WV28 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BLNKQ8WV28 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BLNKQ8WV28 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BLNKQ8WV28 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BLNKQ8WV28 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BLNKQ8WV28 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BLNKQ8WV28 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BLNKQ8WV28 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BLNKQ8WV28 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BLNKQ8WV28 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BLNKQ8WV28 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BLNKQ8WV28 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BLNKQ8WV28 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BLNKQ8WV28 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BLNKQ8WV28 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BLNKQ8WV28 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BLNKQ8WV28 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BLNKQ8WV28 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BLNKQ8WV28 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BLNKQ8WV28 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BLNKQ8WV28 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BLNKQ8WV28 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BLNKQ8WV28 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BLNKQ8WV28 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BLNKQ8WV28 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BLNKQ8WV28 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BLNKQ8WV28 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BLNKQ8WV28 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BLNKQ8WV28 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BLNKQ8WV28 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BLNKQ8WV28 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BLNKQ8WV28 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BLNKQ8WV28 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BLNKQ8WV28 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BLNKQ8WV28 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms