Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA8

TSKU, Tsukushin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKUQ8WUA8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSKUQ8WUA8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TSKUQ8WUA8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms