Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF30

WHAMM, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHAMMQ8TF30 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
WHAMMQ8TF30 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WHAMMQ8TF30 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms