Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
RB1CC1Q8TDY2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
RB1CC1Q8TDY2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
RB1CC1Q8TDY2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC40.33■■■■■ 4.05
RB1CC1Q8TDY2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.05
RB1CC1Q8TDY2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC40.32■■■■■ 4.05
RB1CC1Q8TDY2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.32■■■■■ 4.05
RB1CC1Q8TDY2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC40.32■■■■■ 4.05
RB1CC1Q8TDY2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
RB1CC1Q8TDY2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
RB1CC1Q8TDY2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.32■■■■■ 4.04
RB1CC1Q8TDY2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
RB1CC1Q8TDY2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
RB1CC1Q8TDY2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC40.31■■■■■ 4.04
RB1CC1Q8TDY2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
RB1CC1Q8TDY2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
RB1CC1Q8TDY2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC40.31■■■■■ 4.04
RB1CC1Q8TDY2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
RB1CC1Q8TDY2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
RB1CC1Q8TDY2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
RB1CC1Q8TDY2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
RB1CC1Q8TDY2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
RB1CC1Q8TDY2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
RB1CC1Q8TDY2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
RB1CC1Q8TDY2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC40.3■■■■■ 4.04
RB1CC1Q8TDY2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
RB1CC1Q8TDY2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
RB1CC1Q8TDY2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
RB1CC1Q8TDY2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
RB1CC1Q8TDY2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
RB1CC1Q8TDY2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
RB1CC1Q8TDY2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
RB1CC1Q8TDY2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.29■■■■■ 4.04
RB1CC1Q8TDY2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
RB1CC1Q8TDY2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.29■■■■■ 4.04
RB1CC1Q8TDY2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
RB1CC1Q8TDY2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
RB1CC1Q8TDY2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
RB1CC1Q8TDY2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC40.28■■■■■ 4.04
RB1CC1Q8TDY2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
RB1CC1Q8TDY2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
RB1CC1Q8TDY2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
RB1CC1Q8TDY2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
RB1CC1Q8TDY2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
RB1CC1Q8TDY2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
RB1CC1Q8TDY2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
RB1CC1Q8TDY2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
RB1CC1Q8TDY2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
RB1CC1Q8TDY2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC40.27■■■■■ 4.04
RB1CC1Q8TDY2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
RB1CC1Q8TDY2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC40.27■■■■■ 4.04
RB1CC1Q8TDY2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
RB1CC1Q8TDY2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
RB1CC1Q8TDY2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
RB1CC1Q8TDY2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
RB1CC1Q8TDY2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC40.26■■■■■ 4.04
RB1CC1Q8TDY2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
RB1CC1Q8TDY2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC40.26■■■■■ 4.03
RB1CC1Q8TDY2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
RB1CC1Q8TDY2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
RB1CC1Q8TDY2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
RB1CC1Q8TDY2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
RB1CC1Q8TDY2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
RB1CC1Q8TDY2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
RB1CC1Q8TDY2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
RB1CC1Q8TDY2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
RB1CC1Q8TDY2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
RB1CC1Q8TDY2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC40.24■■■■■ 4.03
RB1CC1Q8TDY2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
RB1CC1Q8TDY2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
RB1CC1Q8TDY2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
RB1CC1Q8TDY2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
RB1CC1Q8TDY2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
RB1CC1Q8TDY2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC40.23■■■■■ 4.03
RB1CC1Q8TDY2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC40.23■■■■■ 4.03
RB1CC1Q8TDY2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
RB1CC1Q8TDY2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
RB1CC1Q8TDY2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
RB1CC1Q8TDY2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
RB1CC1Q8TDY2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC40.23■■■■■ 4.03
RB1CC1Q8TDY2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
RB1CC1Q8TDY2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
RB1CC1Q8TDY2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
RB1CC1Q8TDY2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
RB1CC1Q8TDY2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
RB1CC1Q8TDY2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
RB1CC1Q8TDY2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
RB1CC1Q8TDY2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
RB1CC1Q8TDY2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC40.21■■■■■ 4.03
RB1CC1Q8TDY2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
RB1CC1Q8TDY2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
RB1CC1Q8TDY2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
RB1CC1Q8TDY2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
RB1CC1Q8TDY2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
RB1CC1Q8TDY2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
RB1CC1Q8TDY2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
RB1CC1Q8TDY2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
RB1CC1Q8TDY2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
RB1CC1Q8TDY2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
RB1CC1Q8TDY2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.3 ms