Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA6DQ8NFY4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms