Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DTX3Q8N9I9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DTX3Q8N9I9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms