Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC00612Q8N6U2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms