Protein–RNA interactions for Protein: Q8N309

LRRC43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC43Q8N309 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC43Q8N309 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC43Q8N309 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC43Q8N309 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC43Q8N309 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC43Q8N309 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC43Q8N309 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms