Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LTBP4Q8N2S1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LTBP4Q8N2S1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LTBP4Q8N2S1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LTBP4Q8N2S1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LTBP4Q8N2S1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LTBP4Q8N2S1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LTBP4Q8N2S1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LTBP4Q8N2S1 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LTBP4Q8N2S1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LTBP4Q8N2S1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LTBP4Q8N2S1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LTBP4Q8N2S1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LTBP4Q8N2S1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LTBP4Q8N2S1 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LTBP4Q8N2S1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LTBP4Q8N2S1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LTBP4Q8N2S1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LTBP4Q8N2S1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LTBP4Q8N2S1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LTBP4Q8N2S1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LTBP4Q8N2S1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LTBP4Q8N2S1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LTBP4Q8N2S1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LTBP4Q8N2S1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LTBP4Q8N2S1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LTBP4Q8N2S1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LTBP4Q8N2S1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LTBP4Q8N2S1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LTBP4Q8N2S1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
LTBP4Q8N2S1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LTBP4Q8N2S1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LTBP4Q8N2S1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LTBP4Q8N2S1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LTBP4Q8N2S1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LTBP4Q8N2S1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
LTBP4Q8N2S1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LTBP4Q8N2S1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LTBP4Q8N2S1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LTBP4Q8N2S1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LTBP4Q8N2S1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LTBP4Q8N2S1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LTBP4Q8N2S1 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LTBP4Q8N2S1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LTBP4Q8N2S1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LTBP4Q8N2S1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LTBP4Q8N2S1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LTBP4Q8N2S1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LTBP4Q8N2S1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
LTBP4Q8N2S1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LTBP4Q8N2S1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LTBP4Q8N2S1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LTBP4Q8N2S1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LTBP4Q8N2S1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LTBP4Q8N2S1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
LTBP4Q8N2S1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LTBP4Q8N2S1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LTBP4Q8N2S1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms