Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYT3

CCDC170, Coiled-coil domain-containing protein 170, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC170Q8IYT3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC170Q8IYT3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC170Q8IYT3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC170Q8IYT3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC170Q8IYT3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC170Q8IYT3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms