Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMYD4Q8IYR2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMYD4Q8IYR2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms